Add Noémie's internship.

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Sergiu Ivanov 2023-04-17 21:44:56 +02:00
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@ -747,6 +747,39 @@ de sorte à augmenter l'efficacité du traitement.
\subsection{Encadrement de stages de recherche et développement} \subsection{Encadrement de stages de recherche et développement}
\subsubsection{Auto-assemblage de formes tridimensionnelles par
origami en ADN}
\noindent
\hspace{2.7mm}
{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}%
\begin{tabularx}{\textwidth}{l X}
Stagiaires : & \emph{Noémie \textsc{Harmand}, Université d'Évry} \\
Type : & stage de L3 (double licence bioinfo) \\
Durée : & mai--juin 2023
\end{tabularx}
}
Concevoir des structures pour l'auto-assemblage en ADN présente de
nombreux défis, à toutes les étapes. Déjà au moment de la conception
théorique des séquences d'ADN, il est très pratique d'utiliser
l'approche par origami en ADN. En effet, dans le cas d'origami en ADN,
la forme finale est obtenue en pliant un long brin d'ADN le scaffold
qui ne s'autohybride pas. Étant donné un cheminement du scaffold
dans la figure, les séquences des agrafes peuvent être déduites par
complémentarité des domaines correspondants du scaffold. De surcroît,
les agrafes ont peu de chance de s'hybrider entre elles, étant donné
que le scaffold lui-même ne s'auto-hybride pas. En revanche, cheminer
le scaffold est difficile, notamment dans les
structures tridimensionnelles.
Le point de départ pour ce stage sera une structure de 3 cubes
superposés dans une pile, conçue dans la logiciel ENSnano. Cette
structure, que nous testerons dans des tubes à essai, présente
quelques défauts. L'objectif du stage sera d'interpréter les résultats
de la manipulation d'auto-assemblage, d'améliorer la structure, et de
généraliser sous forme l'algorithme ou ensemble d'heuristiques les
pistes d'amélioration trouvées.
\subsubsection{Stratégies de navigation efficace dans le millefeuille \subsubsection{Stratégies de navigation efficace dans le millefeuille
évolutionnaire} évolutionnaire}
\noindent \noindent