From 8fdd3d9b21a069159138d8669133c6ceb2dc1fe4 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Sergiu Ivanov <sivanov@colimite.fr>
Date: Mon, 17 Apr 2023 21:44:56 +0200
Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Add=20No=C3=A9mie's=20internship.?=
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
Content-Transfer-Encoding: 8bit

---
 recherche.tex | 33 +++++++++++++++++++++++++++++++++
 1 file changed, 33 insertions(+)

diff --git a/recherche.tex b/recherche.tex
index 6eae99a..e9b387b 100644
--- a/recherche.tex
+++ b/recherche.tex
@@ -747,6 +747,39 @@ de sorte à augmenter l'efficacité du traitement.
 
 \subsection{Encadrement de stages de recherche et développement}
 
+\subsubsection{Auto-assemblage de formes tridimensionnelles par
+  origami en ADN}
+\noindent
+\hspace{2.7mm}
+{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}%
+\begin{tabularx}{\textwidth}{l X}
+  Stagiaires : & \emph{Noémie \textsc{Harmand}, Université d'Évry} \\
+  Type : & stage de L3 (double licence bioinfo) \\
+  Durée : & mai--juin 2023
+\end{tabularx}
+}
+
+Concevoir des structures pour l'auto-assemblage en ADN présente de
+nombreux défis, à toutes les étapes. Déjà au moment de la conception
+théorique des séquences d'ADN, il est très pratique d'utiliser
+l'approche par origami en ADN. En effet, dans le cas d'origami en ADN,
+la forme finale est obtenue en pliant un long brin d'ADN – le scaffold
+– qui ne s'autohybride pas. Étant donné un cheminement du scaffold
+dans la figure, les séquences des agrafes peuvent être déduites par
+complémentarité des domaines correspondants du scaffold. De surcroît,
+les agrafes ont peu de chance de s'hybrider entre elles, étant donné
+que le scaffold lui-même ne s'auto-hybride pas. En revanche, cheminer
+le scaffold est difficile, notamment dans les
+structures tridimensionnelles.
+
+Le point de départ pour ce stage sera une structure de 3 cubes
+superposés dans une pile, conçue dans la logiciel ENSnano. Cette
+structure, que nous testerons dans des tubes à essai, présente
+quelques défauts. L'objectif du stage sera d'interpréter les résultats
+de la manipulation d'auto-assemblage, d'améliorer la structure, et de
+généraliser sous forme l'algorithme ou ensemble d'heuristiques les
+pistes d'amélioration trouvées.
+
 \subsubsection{Stratégies de navigation efficace dans le millefeuille
   évolutionnaire}
 \noindent