diff --git a/recherche.tex b/recherche.tex index 6eae99a..e9b387b 100644 --- a/recherche.tex +++ b/recherche.tex @@ -747,6 +747,39 @@ de sorte à augmenter l'efficacité du traitement. \subsection{Encadrement de stages de recherche et développement} +\subsubsection{Auto-assemblage de formes tridimensionnelles par + origami en ADN} +\noindent +\hspace{2.7mm} +{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}% +\begin{tabularx}{\textwidth}{l X} + Stagiaires : & \emph{Noémie \textsc{Harmand}, Université d'Évry} \\ + Type : & stage de L3 (double licence bioinfo) \\ + Durée : & mai--juin 2023 +\end{tabularx} +} + +Concevoir des structures pour l'auto-assemblage en ADN présente de +nombreux défis, à toutes les étapes. Déjà au moment de la conception +théorique des séquences d'ADN, il est très pratique d'utiliser +l'approche par origami en ADN. En effet, dans le cas d'origami en ADN, +la forme finale est obtenue en pliant un long brin d'ADN – le scaffold +– qui ne s'autohybride pas. Étant donné un cheminement du scaffold +dans la figure, les séquences des agrafes peuvent être déduites par +complémentarité des domaines correspondants du scaffold. De surcroît, +les agrafes ont peu de chance de s'hybrider entre elles, étant donné +que le scaffold lui-même ne s'auto-hybride pas. En revanche, cheminer +le scaffold est difficile, notamment dans les +structures tridimensionnelles. + +Le point de départ pour ce stage sera une structure de 3 cubes +superposés dans une pile, conçue dans la logiciel ENSnano. Cette +structure, que nous testerons dans des tubes à essai, présente +quelques défauts. L'objectif du stage sera d'interpréter les résultats +de la manipulation d'auto-assemblage, d'améliorer la structure, et de +généraliser sous forme l'algorithme ou ensemble d'heuristiques les +pistes d'amélioration trouvées. + \subsubsection{Stratégies de navigation efficace dans le millefeuille évolutionnaire} \noindent