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#+TITLE: Introduction à Cytoscape
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#+LANGUAGE: fr
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#+ATTR_HTML: :alt en anglais :class lang-lifted
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[[file:../en/cytoscape-intro.org][file:../content/imgs/en.png]]
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#+ATTR_HTML: :alt retourner à l'accueil :class home
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[[file:home.org][file:../content/imgs/home.png]]
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Cette introduction vise à familiariser rapidement (un TP de 3 ou 4
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heures) les étudiants avec l'usage de base de [[http://cytoscape.org/][Cytoscape]], un outil
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puissant d'analyse de réseaux biologiques. Les étudiants sont invités
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à suivre le [[http://manual.cytoscape.org/en/stable/Basic_Expression_Analysis_Tutorial.html#basic-expression-analysis-tutorial][tutoriel de Cytoscape]], puis l'un des [[http://manual.cytoscape.org/en/stable/Styles.html#styles-tutorials][tutoriels sur les
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styles]], et ensuite à utiliser Cytoscape afin d'analyser une voie de
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signalisation impliquée dans le cancer du sein et de formuler des
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conclusions non triviales.
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Les slides (en anglais) définissant les objectifs de ce TP se trouvent
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[[file:../content/courses/cytoscape-intro/cytoscape-beam.pdf][ici]].
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#+ATTR_HTML: :alt image de la licence Creative Commons Attribution Alone :class ccby
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[[https://fr.wikipedia.org/wiki/Licence_Creative_Commons][file:../content/imgs/ccby.png]]
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Les matériaux de ce cours sont distribués sous la [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Licence_Creative_Commons][licence Creative
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Commons Paternité]].
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* Local Variables :noexport:
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# Local Variables:
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# org-link-file-path-type: relative
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# eval: (auto-fill-mode)
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# ispell-local-dictionary: "fr"
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# End:
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