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Je suis maître de conférences à l'Université d'Évry, Université Paris-Saclay. J'effectue mes travaux de recherche au laboratoire IBISC.
Contactez-moi à l'adresse sergiu $_{dot}$ ivanov (at)
univ-evry.fr .
Voici mon rapport d'activité de 2019 à 2023.
Liens rapides :
Mon actualité
| [2023-07-12] | Notre article A P Systems Variant for Reasoning about Sequential Controllability of Boolean Networks vient d'être publié (preprint). |
| [2023-05-29] | Je bénéficierai d'un CRCT pour l'année 2023/2024. |
| [2023-04-14] | Notre article Numerical networks of cells vient d'être publié. |
Lecture du moment: Damien Woods, David Doty, Cameron Myhrvold, Joy Hui, Felix Zhou, Peng Yin, Erik Winfree. Diverse and robust molecular algorithms using reprogrammable DNA self-assembly.
Recherche
Actuellement, je travaille activement sur
biologie théorique nanotechnologie en ADN calcul naturel informatique théorique
Je travaille également sur
langages formels réécriture biologie de réseaux complexité modélisation biologique
J'ai de l'expérience avec les modèles formels suivants (et similaires) :
systèmes à membranes réseaux booléens systèmes à réactions
machines à registres
réseaux de Petri
Je suis intéressé par les structures formelles et abstraites et par leurs diverses connexions à la réalité biologique.
Publications
Je maintiens une liste complète de mes publications.
Une liste assez complète de mes publications est aussi disponible sur ma page DBLP. Vous trouverez également une liste de mes publications sur HAL, avec les fichiers PDF pour certaines.
Mon numéro ORCID est 0000-0002-1537-6508 et j'ai un profil ResearchGate.
Enfin, jetez un œil à cette initiative: https://nofreeviewnoreview.org/.
Enseignement
Voici une liste des cours que j'ai préparés, dans l'ordre chronologique :
- nanotechnologies en ADN, avec Damien Regnault, en anglais mot de
passe:
m2geniomhe-dna - introduction au calcul à membranes, avec David Orellana-Martín et Ricardo Graciani, en anglais, envoyez-moi un message pour avoir le mot de passe
- introduction à LaTeX et à Git, mot de passe:
ppei-l3 - systèmes d'exploitation, mot de passe:
sye-l3 - une introduction très rapide à la vie artificielle
- réseaux de Petri pour la biomodélisation
- introduction à Cytoscape
- To Git or Not to Git
- Haskell for Life
- introduction au systèmes d'exploitation et réseaux
- bases de l'analyse syntaxique
Les matériaux des cours sont distribués sous la licence Creative Commons Paternité, à part si le contraire est indiqué sur la page du cours.
Séminaires
Voici quelques diapositives de mes séminaires :
- The Many Shapes of Polymorphism (diapositives)
- Sequential Reprogramming of Biological Network Fate (diapositives)
- Understanding Evolution: A Methodology for Evaluating the Extensibility of Boolean Networks’ Structure and Function (diapositives)
Ces matériaux sont distribués sous la licence Creative Commons Paternité.
Programmation
Je développe dds, une boîte à outils faite maison pour travailler avec des systèmes dynamiques discrets en Racket, un dialecte moderne de Lisp.
Par le passé, j'ai écrit beaucoup de lignes de Haskell. Voici mon profil GitHub.
Rôles
J'anime avec Farida Zehraoui le groupe de travail Axe transverse Médecine personnalisée à IBISC.
Je suis recommender pour Peer Community In Mathematical and Computational Biology.
Je suis membre du comité éditorial de la revue Computer Science Journal of Moldova.
Je suis membre élu de la Commission de la Recherche et du Conseil Académique de l'Université d'Évry.
Je suis membre élu du Conseil de la Graduate School « Informatique et sciences du numérique » de l'Université Paris-Saclay.
Je suis membre élu du Conseil du laboratoire IBISC.
Je suis membre du Conseil des Utilisateurs du Numérique de l'Université d'Évry.
Anciens postes
- 2016–2017 : Postdoc avec Nicolas Glade sur la modélisation biomécanique du cytosquelette, ainsi que sur de divers aspects du calcul non conventionnel, de la biologie théorique et de l'épistémologie.
- 2015–2016 : ATER à l'Université Paris Est Créteil.
- 2012–2015 : Doctorant à l'Université Paris Est Créteil sous la direction de Sergey Verlan. J'ai soutenu ma thèse intitulée « Étude de la puissance d'expression et de l'universalité des modèles de calcul inspirés par la biologie » en 2015 (diapositives, en anglais).
Adresse de contact
Sergiu Ivanov
Bureau: 319
IBISC - IBGBI – 3ème étage
23, boulevard de France
91034 Évry, France