#+TITLE: Introduction à Cytoscape

#+LANGUAGE: fr

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Cette introduction vise à familiariser rapidement (un TP de 3 ou 4
heures) les étudiants avec l'usage de base de [[http://cytoscape.org/][Cytoscape]], un outil
puissant d'analyse de réseaux biologiques. Les étudiants sont invités
à suivre le [[http://manual.cytoscape.org/en/stable/Basic_Expression_Analysis_Tutorial.html#basic-expression-analysis-tutorial][tutoriel de Cytoscape]], puis l'un des [[http://manual.cytoscape.org/en/stable/Styles.html#styles-tutorials][tutoriels sur les
styles]], et ensuite à utiliser Cytoscape afin d'analyser une voie de
signalisation impliquée dans le cancer du sein et de formuler des
conclusions non triviales.

Les slides (en anglais) définissant les objectifs de ce TP se trouvent
[[file:../content/courses/cytoscape-intro/cytoscape-beam.pdf][ici]].

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[[https://fr.wikipedia.org/wiki/Licence_Creative_Commons][file:../content/imgs/ccby.png]]

Les matériaux de ce cours sont distribués sous la [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Licence_Creative_Commons][licence Creative
Commons Paternité]].


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