diff --git a/recherche.tex b/recherche.tex index 8df318d..306bd1e 100644 --- a/recherche.tex +++ b/recherche.tex @@ -740,6 +740,46 @@ de sorte à augmenter l'efficacité du traitement. \subsection{Encadrement de stages de recherche et développement} +\subsubsection{Millefeuille évolutionnaire : une nouvelle formalisation de l'évolution} +\noindent +\hspace{2.7mm} +{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}% +\begin{tabularx}{\textwidth}{l X} + Stagiaires : & \emph{Rémy \textsc{Défossez}, ENS Paris} \\ + Type : & stage de L3 d'initiation à la recherche \\ + Durée : & 15 juin--15 août 2021 +\end{tabularx} +} + +La pression évolutionnaire rend certaines fonctions plus ou moins +pertinentes, et la plasticité des organismes suit en augmentant ou en +réduisant l'ensemble de différentes réalisations. Pour une espèce +donnée et à chaque moment de temps donné, nous pouvons établir une +image arrêtée de fonctions et de différents réseaux qui les +réalisent. Cette image évolue dans le temps, donnant lieu à un +\emph{millefeuille évolutionnaire} d'espaces de réseaux et de +fonctions associées. Il est possible de retrouver des fonctions très +similaires dans les couches adjacentes et de comparer les sous-espaces +des réseaux correspondants. Ces sous-espaces s'alignent dans des tubes +évolutionnaires, dont la topologie représente la trace d'une fonction +donnée et des réseaux d'interactions associés dans l'historique d'une +espèce. Le millefeuille évolutionnaire est ainsi une construction +similaire aux paysages épigénétiques de Waddington. + +Ce travail de stage pourra s'organiser dans les trois grandes étapes +suivantes : +\begin{enumerate} +\item Définir formellement le \emph{millefeuille évolutionnaire} comme + une suite infinie de réseaux booléens reliés par des + liens évolutionnaires. +\item Définir formellement les \emph{tubes évolutionnaires} comme des suites + infinies de fonctions identifiables dans les couches adjacentes du + millefeuille évolutionnaire, et bénéficiant d'un degré de + similarité élevé. +\item Commencer l'exploration de la \emph{complexité} des tubes + évolutionnaires en se fondant sur les travaux précédents. +\end{enumerate} + \subsubsection{Évolution artificielle des réseaux booléens à signe} \noindent \hspace{2.7mm}