From ab1f3b312c2b2bba05d505dccaf70cf3a36007fc Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Sergiu Ivanov Date: Sun, 31 May 2020 17:57:11 +0200 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Rewrite=20the=20presentation=20of=20J=C3=A9r?= =?UTF-8?q?=C3=A9mie's=20thesis.?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- recherche.tex | 41 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++---- 1 file changed, 37 insertions(+), 4 deletions(-) diff --git a/recherche.tex b/recherche.tex index 486c199..7f7a05f 100644 --- a/recherche.tex +++ b/recherche.tex @@ -727,14 +727,47 @@ pour les actes de colloques suivants : {\em Conference on Membrane \end{tabularx} \subsection{Encadrement de thèses de doctorat} + +\subsubsection{Jérémie \textsc{Pardo}} \noindent -\begin{tabu}{X[.19r] c X[j]}\savetabu{sciroles} - 2018--2021 & $\bullet$ & \textbf{Jérémie \textsc{Pardo}}, Approche abductive de l'inférence de cibles thérapeutiques et de séquences de traitement\\ -\end{tabu} +\hspace{2.7mm} +{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}% +\begin{tabularx}{\textwidth}{l X} + Titre : & \emph{Approche abductive de l'inférence de cibles thérapeutiques et de séquences de traitement} \\ + Durée : & 2018--2021 +\end{tabularx} +} + +L'un des enjeux principaux de la médecine de précision est la +recherche des thérapies spécifiques, adaptées au patient. Cette +recherche nécessite une analyse approfondie des interactions entre +différentes entités participant au déroulement de la maladie : gènes, +protéines, etc. L'actuel outil de préférence pour cette analyse sont +les réseaux, l'objet fondamental donnant lieu à un domaine entier : la +médecine des réseaux. + +Dans cette thèse, nous travaillons sur les réseaux booléens : un +concept informatique abstrait consistant en un ensemble de variables +booléennes mises à jour selon des fonctions de mise à jour +correspondantes. Ces fonctions induisent un ensemble d'interactions +entre les variables. Les réseaux booléens sont particulièrement bien +adaptés à l'analyse des réseaux de signalisation ou des réseaux de +régulation génétiques, car dans ces systèmes les signaux se propagent +par absence ou présence d'une protéine, ou par activation ou +inhibition d'un gène. + +L'objectif de cette thèse est d'appliquer les réseaux booléens au +problème de recherche des thérapies : en partant des modèles booléens +des réseaux essentiels pour la genèse de la maladie, nous ambitionnons +de trouver les façons de reprogrammer ces réseaux de sorte à corriger +leur comportement ou même d'éviter qu'il diverge du sain. Nous nous +intéressons particulièrement aux perturbations séquentielles : nous +cherchons donc à étaler les actions de reprogrammation dans le temps +de sorte à augmenter l'efficacité du traitement. \subsection{Rôles scientifiques} \noindent -\begin{tabu}{\usetabu{sciroles}} +\begin{tabu}{X[.19r] c X[j]}\savetabu{sciroles} 2020--\phantom{2020} & $\bullet$ & Co-animateur avec Farida \textsc{Zehraoui} de l'axe transversal « Médecine personnalisée » du laboratoire IBISC \\