Rewrite the presentation of Jérémie's thesis.

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Sergiu Ivanov 2020-05-31 17:57:11 +02:00
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@ -727,14 +727,47 @@ pour les actes de colloques suivants : {\em Conference on Membrane
\end{tabularx}
\subsection{Encadrement de thèses de doctorat}
\subsubsection{Jérémie \textsc{Pardo}}
\noindent
\begin{tabu}{X[.19r] c X[j]}\savetabu{sciroles}
2018--2021 & $\bullet$ & \textbf{Jérémie \textsc{Pardo}}, Approche abductive de l'inférence de cibles thérapeutiques et de séquences de traitement\\
\end{tabu}
\hspace{2.7mm}
{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}%
\begin{tabularx}{\textwidth}{l X}
Titre : & \emph{Approche abductive de l'inférence de cibles thérapeutiques et de séquences de traitement} \\
Durée : & 2018--2021
\end{tabularx}
}
L'un des enjeux principaux de la médecine de précision est la
recherche des thérapies spécifiques, adaptées au patient. Cette
recherche nécessite une analyse approfondie des interactions entre
différentes entités participant au déroulement de la maladie : gènes,
protéines, etc. L'actuel outil de préférence pour cette analyse sont
les réseaux, l'objet fondamental donnant lieu à un domaine entier : la
médecine des réseaux.
Dans cette thèse, nous travaillons sur les réseaux booléens : un
concept informatique abstrait consistant en un ensemble de variables
booléennes mises à jour selon des fonctions de mise à jour
correspondantes. Ces fonctions induisent un ensemble d'interactions
entre les variables. Les réseaux booléens sont particulièrement bien
adaptés à l'analyse des réseaux de signalisation ou des réseaux de
régulation génétiques, car dans ces systèmes les signaux se propagent
par absence ou présence d'une protéine, ou par activation ou
inhibition d'un gène.
L'objectif de cette thèse est d'appliquer les réseaux booléens au
problème de recherche des thérapies : en partant des modèles booléens
des réseaux essentiels pour la genèse de la maladie, nous ambitionnons
de trouver les façons de reprogrammer ces réseaux de sorte à corriger
leur comportement ou même d'éviter qu'il diverge du sain. Nous nous
intéressons particulièrement aux perturbations séquentielles : nous
cherchons donc à étaler les actions de reprogrammation dans le temps
de sorte à augmenter l'efficacité du traitement.
\subsection{Rôles scientifiques}
\noindent
\begin{tabu}{\usetabu{sciroles}}
\begin{tabu}{X[.19r] c X[j]}\savetabu{sciroles}
2020--\phantom{2020} & $\bullet$ & Co-animateur avec Farida
\textsc{Zehraoui} de l'axe transversal « Médecine personnalisée » du
laboratoire IBISC \\