Rewrite the presentation of Jérémie's thesis.
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@ -727,14 +727,47 @@ pour les actes de colloques suivants : {\em Conference on Membrane
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\end{tabularx}
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\subsection{Encadrement de thèses de doctorat}
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\subsubsection{Jérémie \textsc{Pardo}}
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\begin{tabu}{X[.19r] c X[j]}\savetabu{sciroles}
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2018--2021 & $\bullet$ & \textbf{Jérémie \textsc{Pardo}}, Approche abductive de l'inférence de cibles thérapeutiques et de séquences de traitement\\
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\end{tabu}
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\hspace{2.7mm}
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{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}%
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\begin{tabularx}{\textwidth}{l X}
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Titre : & \emph{Approche abductive de l'inférence de cibles thérapeutiques et de séquences de traitement} \\
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Durée : & 2018--2021
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\end{tabularx}
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}
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L'un des enjeux principaux de la médecine de précision est la
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recherche des thérapies spécifiques, adaptées au patient. Cette
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recherche nécessite une analyse approfondie des interactions entre
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différentes entités participant au déroulement de la maladie : gènes,
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protéines, etc. L'actuel outil de préférence pour cette analyse sont
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les réseaux, l'objet fondamental donnant lieu à un domaine entier : la
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médecine des réseaux.
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Dans cette thèse, nous travaillons sur les réseaux booléens : un
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concept informatique abstrait consistant en un ensemble de variables
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booléennes mises à jour selon des fonctions de mise à jour
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correspondantes. Ces fonctions induisent un ensemble d'interactions
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entre les variables. Les réseaux booléens sont particulièrement bien
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adaptés à l'analyse des réseaux de signalisation ou des réseaux de
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régulation génétiques, car dans ces systèmes les signaux se propagent
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par absence ou présence d'une protéine, ou par activation ou
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inhibition d'un gène.
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L'objectif de cette thèse est d'appliquer les réseaux booléens au
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problème de recherche des thérapies : en partant des modèles booléens
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des réseaux essentiels pour la genèse de la maladie, nous ambitionnons
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de trouver les façons de reprogrammer ces réseaux de sorte à corriger
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leur comportement ou même d'éviter qu'il diverge du sain. Nous nous
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intéressons particulièrement aux perturbations séquentielles : nous
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cherchons donc à étaler les actions de reprogrammation dans le temps
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de sorte à augmenter l'efficacité du traitement.
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\subsection{Rôles scientifiques}
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\noindent
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\begin{tabu}{\usetabu{sciroles}}
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\begin{tabu}{X[.19r] c X[j]}\savetabu{sciroles}
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2020--\phantom{2020} & $\bullet$ & Co-animateur avec Farida
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\textsc{Zehraoui} de l'axe transversal « Médecine personnalisée » du
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laboratoire IBISC \\
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