Add Noémie's internship.
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@ -747,6 +747,39 @@ de sorte à augmenter l'efficacité du traitement.
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\subsection{Encadrement de stages de recherche et développement}
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\subsubsection{Auto-assemblage de formes tridimensionnelles par
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origami en ADN}
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\hspace{2.7mm}
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{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}%
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\begin{tabularx}{\textwidth}{l X}
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Stagiaires : & \emph{Noémie \textsc{Harmand}, Université d'Évry} \\
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Type : & stage de L3 (double licence bioinfo) \\
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Durée : & mai--juin 2023
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\end{tabularx}
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}
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Concevoir des structures pour l'auto-assemblage en ADN présente de
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nombreux défis, à toutes les étapes. Déjà au moment de la conception
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théorique des séquences d'ADN, il est très pratique d'utiliser
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l'approche par origami en ADN. En effet, dans le cas d'origami en ADN,
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la forme finale est obtenue en pliant un long brin d'ADN – le scaffold
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– qui ne s'autohybride pas. Étant donné un cheminement du scaffold
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dans la figure, les séquences des agrafes peuvent être déduites par
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complémentarité des domaines correspondants du scaffold. De surcroît,
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les agrafes ont peu de chance de s'hybrider entre elles, étant donné
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que le scaffold lui-même ne s'auto-hybride pas. En revanche, cheminer
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le scaffold est difficile, notamment dans les
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structures tridimensionnelles.
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Le point de départ pour ce stage sera une structure de 3 cubes
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superposés dans une pile, conçue dans la logiciel ENSnano. Cette
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structure, que nous testerons dans des tubes à essai, présente
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quelques défauts. L'objectif du stage sera d'interpréter les résultats
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de la manipulation d'auto-assemblage, d'améliorer la structure, et de
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généraliser sous forme l'algorithme ou ensemble d'heuristiques les
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pistes d'amélioration trouvées.
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\subsubsection{Stratégies de navigation efficace dans le millefeuille
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évolutionnaire}
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