diff --git a/recherche.tex b/recherche.tex index c777db1..d2d1cc5 100644 --- a/recherche.tex +++ b/recherche.tex @@ -744,6 +744,49 @@ de sorte à augmenter l'efficacité du traitement. \subsection{Encadrement de stages de recherche et développement} +\subsubsection{Stratégies de navigation efficace dans le millefeuille + évolutionnaire} +\noindent +\hspace{2.7mm} +{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}% +\begin{tabularx}{\textwidth}{l X} + Stagiaires : & \emph{Ai-Ling \textsc{Bonnet}, CentraleSupélec} \\ + Type : & stage de 2ème année \\ + Durée : & septembre 2022--janvier 2023 +\end{tabularx} +} + +L'instrument principal de l'évolution est la sélection naturelle, le +processus selon lequel les organismes moins adaptés à un moment et +à un lieu se voient défavorisés par rapport à d'autres. L'évolution et +la sélection naturelle créent alors un historique passionnant de la +vie, que l'on peut lire dans les couches géologiques mais aussi dans +les diverses structures présentes dans les organismes mêmes et dans +les arbres phylogénétiques qui permettent dans une certaine mesure de +remonter le temps parcouru par l'évolution. + +L'évolution d'un écosystème peut être vue comme une suite d'images +arrêtées, rendant compte des paramètres des organismes membres +à chaque moment. En supposant qu'un réseau booléen soit une +abstraction forte, mais adaptée d'un organisme, chacune de ces images +devient un ensemble de réseaux régissant les fonctions manifestées +à cet instant. L'évolution de l'écosystème devient ainsi un empilement +de tels ensembles sur l'axe du temps : le millefeuille évolutionnaire. +Dans ce millefeuille, on peut retrouver dans des couches adjacentes +des réseaux similaires par leur structure ou par leur fonction. +Cette relation d'adjacence définit les tubes évolutionnaires, +retraçant l'évolution des caractéristiques des réseaux. Le +millefeuille évolutionnaire est ainsi une construction similaire aux +paysages épigénétiques de Waddington. + +L'évolution des organismes peut être perçue comme des trajectoires +dans ce millefeuille. Ces trajectoires sont de longueur différente, et +surtout elle doivent nécessairement éviter les zones non viables du +millefeuille. Ce stage est une suite naturelle du stage de Rémy +\textsc{Défossez} et aura comme objectif d'approfondir et étendre les +formalismes, ainsi que d'affiner les explorations numériques du +millefeuille évolutionnaire. + \subsubsection{Contrôlabilité des systèmes complexes} \noindent \hspace{2.7mm}