Add Ai-Ling's internship.

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Sergiu Ivanov 2022-03-30 17:52:19 +02:00
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@ -744,6 +744,49 @@ de sorte à augmenter l'efficacité du traitement.
\subsection{Encadrement de stages de recherche et développement}
\subsubsection{Stratégies de navigation efficace dans le millefeuille
évolutionnaire}
\noindent
\hspace{2.7mm}
{\renewcommand{\arraystretch}{1.3}%
\begin{tabularx}{\textwidth}{l X}
Stagiaires : & \emph{Ai-Ling \textsc{Bonnet}, CentraleSupélec} \\
Type : & stage de 2ème année \\
Durée : & septembre 2022--janvier 2023
\end{tabularx}
}
L'instrument principal de l'évolution est la sélection naturelle, le
processus selon lequel les organismes moins adaptés à un moment et
à un lieu se voient défavorisés par rapport à d'autres. L'évolution et
la sélection naturelle créent alors un historique passionnant de la
vie, que l'on peut lire dans les couches géologiques mais aussi dans
les diverses structures présentes dans les organismes mêmes et dans
les arbres phylogénétiques qui permettent dans une certaine mesure de
remonter le temps parcouru par l'évolution.
L'évolution d'un écosystème peut être vue comme une suite d'images
arrêtées, rendant compte des paramètres des organismes membres
à chaque moment. En supposant qu'un réseau booléen soit une
abstraction forte, mais adaptée d'un organisme, chacune de ces images
devient un ensemble de réseaux régissant les fonctions manifestées
à cet instant. L'évolution de l'écosystème devient ainsi un empilement
de tels ensembles sur l'axe du temps : le millefeuille évolutionnaire.
Dans ce millefeuille, on peut retrouver dans des couches adjacentes
des réseaux similaires par leur structure ou par leur fonction.
Cette relation d'adjacence définit les tubes évolutionnaires,
retraçant l'évolution des caractéristiques des réseaux. Le
millefeuille évolutionnaire est ainsi une construction similaire aux
paysages épigénétiques de Waddington.
L'évolution des organismes peut être perçue comme des trajectoires
dans ce millefeuille. Ces trajectoires sont de longueur différente, et
surtout elle doivent nécessairement éviter les zones non viables du
millefeuille. Ce stage est une suite naturelle du stage de Rémy
\textsc{Défossez} et aura comme objectif d'approfondir et étendre les
formalismes, ainsi que d'affiner les explorations numériques du
millefeuille évolutionnaire.
\subsubsection{Contrôlabilité des systèmes complexes}
\noindent
\hspace{2.7mm}