phd-defence-fr/otb.general.tex

56 lines
1.9 KiB
TeX

\begin{frame}%[label=this one]
\frametitle{OTB, un simulateur de bactéries}
\begin{columns}
\column{.7\textwidth}
\begin{itemize}
\item \structure{Motivations}
\begin{itemize}
\item \structure{Assister} le travail du programmeur (L1, L2)
\item \structure{Observer} la morphogenèse à partir de la spécification
d'un comportement local
\end{itemize}
\medskip
\item \structure{Objectifs}
\begin{itemize}
\item Simulation raisonnable de grandes populations\\($10^5$ individus)
\item Simulation réaliste
\end{itemize}
\medskip
\item \structure{Utilisation du parallélisme}
\begin{itemize}
\item Nécessaire pour accélérer les calculs
\item Largement disponible (Multi-cœur, GPU)
\end{itemize}
\end{itemize}
\column{.2\textwidth}
\tourdelangages
\begin{tikzpicture}[overlay,
big red/.style={line width=1mm,line cap=round,red}]
\draw[big red] (genotype.south west) to (genotype.north east);
\draw[big red] (genotype.north west) to (genotype.south east);
\end{tikzpicture}
\end{columns}
\end{frame}
% Il nous faut un simulateur pour:
% \begin{itemize}
% \item Observer de l'expression d'un RRG au niveau de la population
% \item Tester des hypothèses et guider le design de L1 et L2
% \item Palier le manque de composants biologique dans le projet
% \end{itemize}
%
% \medskip Propriétés souhaitables:
% \begin{itemize}
% \item Simulation raisonnable de grandes populations ($10^5$ individus)
% \item Simulation réaliste
% \item Simulateur générique et modulaire pour adaptation facile à d'autres
% problématiques
% \end{itemize}
%
% \medskip Utilisation du parallélisme car
% \begin{itemize}
% \item nécessaire pour accélérer les calculs
% \item largement disponible (Multi-cœur, GPU)
% \end{itemize}